為做好污染源治理，合理使用污染源治理資金，提高社會效益。1988年國務院發布《污染源治理專項基金有償使用暫行辦法》[中華人民共和國國務院令（第10號）]，從重點排污單位污染源治理補助資金中提取20%～30%比例的資金用來設立污染源治理專項基金，實行基金有償使用，委托銀行貸款給符合條件的超標排污企業，用于重點污染源治理項目，“三廢”綜合利用項目，污染源治理示范工程以及實行并、轉、遷的污染源治理設施等四類工程項目。建設項目正式投產或使用前須向負責審批貸款的環境保護部門提交污染源治理項目竣工驗收報告，經驗收合格的，環保部門可以給予企業豁免一定數額的貸款本金。