近年來財政生態環境支出絕對值不斷增加，但這也是我國總體經濟水平不斷提高的一個結果，從相對水平看，并未實現大幅度增長。以中央財政為例，2010—2018年中央生態環境轉移支付占轉移支付總額的比例為4.6%～6.4%，但整體呈下降趨勢，從2010年的6.4%下降至2018年的4.8%，未隨著中央轉移支付力度的加大同步增大支出規模。我國環境保護本來就歷史欠賬多，加上新的環境問題的不斷涌現，目前財政投入總量與環境治理資金需求之間仍有很大差距。另外，長期以來，財政生態環境資金重投資、輕效益的項目實施與管理方式，導致許多項目雖然有固定資產形成，但后期運行維護資金缺乏，不能有效發揮投資效益。不少地方為爭取財政資金只重項目立項建設，輕項目投產運行，造成環保設施建好后的實際使用率很低，造成資金浪費，拉低資金使用效益。