能源消費與碳排放和污染物排放之間存在著內在關聯，伴隨著大灣區內能源、環境約束趨緊，三地能源基礎設施也都面臨著升級換代和清潔低碳轉型壓力，大灣區急需打破條塊分割的管理體制，建立全區統一的能源環境管理體系。相較與其他國際灣區，粵港澳大灣區煤炭和煤電所占比例依舊很高。因此，要提高大灣區能源利用效率，需要大灣區陸海統籌、內外并舉，構建清潔、低碳、安全、高效的能源體系。但是目前看，大多城市出臺的政策方案大多立足本區域的能源轉型目標，缺乏統一的能源規劃頂層設計。