燃料電池目前已形成較完整體系：

 

（1）按電解質類別可分為：堿性燃料電池（alkaline fuel cell，AFC），磷酸燃料電池（phosphoric acid fuel cell，PAFC），熔融碳酸鹽燃料電池（molten carbonate fuel cell，MCFC），固體氧化物燃料電池（solid oxide fue lcell，SOFC），質子交換膜燃料電池（proton exchange membrane fuel cell，PEMFC）和直接甲醇燃料電池（direct methanol fuel cell，DMFC）。其中，目前尚處于開發階段的DMFC采用全氟磺酸膜做電解質，工作溫度為室溫至200℃，用于微型移動電源。

 

（2）按燃料類別和反應機理可分為氫型、碳型、氮型和有機物型燃料電池。以H2、甲醇（CH3OH）、聯氨（N2H4）、烴類及一氧化碳（CO）等為燃料的燃料電池又稱氫氧燃料電池；以鋁（Al）、鎂（Mg）、鋰（Li）和鋅（Zn）等輕金屬為燃料，以O2作為氧化劑的電池稱為金屬空氣燃料電池，分別為Al空氣電池、Mg-空氣電池、Li-空氣電池和Zn-空氣電池。2018年，中科院寧波材料技術與工程研究所聯合浙江省石墨烯制造業創新中心研制出能量密度545Wh/kg、容量130kWh的石墨烯基鋁燃料電池系統。

 

（3）按工作溫度分為高溫燃料電池（＞400℃）、中溫燃料電池和常（低）溫燃料電池。