第一階段為2015—2017年，納入電力、工業、建筑、廢物和運輸（國內航空）五個部門，所有
碳排放配額全部免費分配；
第二階段為2018—2020年，加入了公共部門，共細分為62個二級部門，97%的配額免費分配；
第三階段于2021-2025年，納入了建筑業和大型交通運輸業（包括貨運、鐵路、客運和航運），二級部門增加至69個，增加后覆蓋碳排總量提高到覆蓋率73.5%并，且免費分配的比例將下降到90%以下。
從第三階段開始，金融機構將進入基于
碳配額的二級交易市場，以完善第二階段中的做市商制度。具體來說：第一，韓國碳市場將允許證券公司和個人等其他參與者進入二級市場；第二，將引入衍生品來提升市場功能，確保交易條件帶來的穩定性和靈活性。
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