價格波動性。
碳交易中排放
價格由于市場原因，會有較大的波動性，增加 企業的遵從成本。而減少此波動性，只能依靠市場制度的完善和市場主體 自身意識的提高，故
碳交易的減排成本有較大的不確定性。
管理成本高。
碳排放交易初始排放權的分配，由于各方利益的博弈，需要 經過一個較長時期的談判，且還需要建立相應的排放權交易市場以及建立 參與企業能源使用的報告機制、監控機制與懲罰機制，這些都需要較大的 額外管理成本。
可能導致公平缺失。從公平性角度看，稅收是優選的政策。碳排放交易采 用初始排放權免費配給制度，相當于將全社會的收入免費送給排放企業， 不可避免地會產生尋租的問題。
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