為了獲得CERs和ERUs，CDM和JI必須設置一些標準的細節規則。項目開發商需要提供項目方法以進行基線排放的計算和監測計劃，并向CDM執行理事會（EB）提交申請通過。項目開發商可通過現有的項目方法或者提出新的方法來進行項目的設計開發。同時CDM執行理事會（EB）還商定了一套規則用以確定額外性的方法。

由CDM執行理事會（EB）審核通過的指定經營實體（DOE）需要準備項目設計文檔（PDD），其中包括額外性的分析，基線的計算和監測計劃。審核過程中需要深入研究項目設計文檔（PDD）以確保其符合現行的規定，然后提交CDM執行理事會（EB）。項目實施后，另外一個指定經營實體（DOE）（不同于項目實施方的）需要核實項目是否真正實現了溫室氣體的減排。項目核查包括文件核查和現場核查。認證是由指定經營實體（DOE）提供書面材料確認其項目確實達到了核實的溫室氣體減排量。小型項目也必須采用指定經營實體（DOE）的認證服務，但允許進行方法簡化，并降低交易費用。SGS、KPMG和日本咨詢學會都是經認可的指定經營實體（DOE）。顯然，注冊費用與使用指定經營實體（DOE）的服務都是一個漫長、復雜且昂貴的過程。