在新發展理念背景下，隨著污染防治攻堅戰向縱深發展，傳統清潔生產審核工作的問題不斷顯現。一是隨著經濟社會迅猛發展，工業企業成數量級增長，清潔生產工作強度不斷增大，同類型企業單個審核人力財力重復投入，部分地區甚至出現走過場、形式化現象，同時還存在審核周期長、程序復雜、不分行業“一刀切”等問題。二是傳統清潔生產審核以單一企業為審核對象，具有較大的局限性，難以滿足快速有效提升行業、園區和產業集群整體清潔生產水平的現實需要，無法有效支撐重點行業、重點區域減污降碳和產業升級改造。三是清潔生產審核制度與環境影響評價、排污許可、重污染天氣應急響應、碳排放報告與核查等環境管理制度銜接不夠，未有效發揮清潔生產在促進多污染物和溫室氣體協同治理、提升生態環境治理和監管效能方面的作用。